Os interesses de José
de Anchieta mudam no decorrer do tempo, conforme as próprias
políticas circunstanciais da Coroa, principalmente a respeito
daquilo que seria o patrimônio territorial, incluindo nesse sentido
os índios, radicalmente contra a dominação lusitana.
Men de Sá, governador
do Brasil que veio da Bahia para reforçar seu sobrinho Estácio de
Sá, ao comando das operações de extermínio dos confederados,
convencido de liquidar o poder dos Tamoio em favor da Coroa, o padre
da companhia de Jesus, cuja missão era a evangelização e
pacificação dos índios, adoçou a situação dramática de Rio de
Janeiro, insuflando o governador geral sobre a carnificina de
portugueses e, na hora do acerto de contas, assumiu o lugar de
soldado, lutando no campo de batalha.